New Nintendo 3DS XL har fått en extra spak, C-spaken. Den hittar du ovanför A, B, X och Y-knappen. Med den spaken kan du göra små och mjuka rörelser. Det finns också ZR- och ZL-knappar på New Nintendo 3DS. Den funktion som Circle Pad Pro hade är integrerad i New Nintendo 3DS, vilket är väldigt användbart när du spelar vissa spel som till exempel Monster Hunter 4 Ultimate.
Med dessa tillägg blir det både lättare att surfa på internet och få ännu bättre kontrollmöjligheter när du spelar.

New Nintendo 3DS XL har en snabbare och kraftfullare processor. Förutsatt att du har en snabb bredbandsuppkoppling så kommer du märka att New Nintendo 3DS XL laddar ned applikationer betydligt snabbare än Nintendo 3DS. Det kommer också komma spel som använder sig av den här nya processorkraften.

NFC-funktionen är inbyggd i New Nintendo 3DS XL så den är redo att använda amiibo-figurer när kompatibla spel finns tillgängliga. Det är bara att sätta din amiibo på pekskärmen på New Nintendo 3DS XL så läser den av din amiibo.

Betydligt skönare 3D-upplevelse med den nya superstabila 3D-funktionen. New Nintendo 3DS XL känner av var ditt ansikte befinner sig med hjälp av en kamera som automatiskt justerar sig så att du ska få bästa möjliga 3D-upplevelse när du spelar. Observera dock att barn under sex år ej bör använda sig av 3D-effekten när de spelar. Använd föräldrakontrollen i New Nintendo 3DS XL för att undvika att barn använder sig av 3D-funktionen.